پایان نامه: آنالیز بیان چندین ژن مهم در مسیر Signal transductionو پارامترهای فیزیولوژیک مرتبط با آن در پاسخ به تنش خشکی در دو رقم حساس و مقاوم گیاه کلزا |
فهرست مطالب
عنوان صفحه
1 | فصل اول: کلیات .. |
2 | 1-1 گیاهشناسی کلزا …… |
2 | 1-1-1 ارقام کلزا |
4 | 1-1-2 کلزا و اهمیت اقتصادی آن … |
5 | 1-2 تنش خشکی .. |
8 | 1-2-1 مکانیسمهای مقاومت به خشکی در گیاهان زراعی . |
11 | 1-2-2 اثر تنش خشکی بر روی کلزا … |
12 | 1-2-3- ﺗﺄثیر تنش خشکی بر رشد و فتوسنتز |
14 | 1-2-4 اثر تنش خشکی روی آنزیم های آنتیاکسیدانت و مالوندیآلدهید |
18 | 1-2-5 ﺗﺄثیرتنش خشکی بر میزان نیترات و نیترات ردوکتاز . |
19 | 1-2-6 ﺗﺄثیر تنش خشکی بر القای اسمولیتهای سازگار |
21 | 1-3 کلیاتی در زمینه مسیر درک علامت (Singal transduction) در گیاهان . |
21 | 1-3-1 اثر تنشهای محیطی در فرایندهای مولکولی در گیاهان . |
23 | 1-3-2 مسیرهای ژنهای کنترل کننده تنشهای غیرزنده |
24 | 1-4 ژنهای مورد مطالعه .. |
24 | 1-4-1 پروتئینکینازها |
26 | 1-4-2 خانواده ژنیMAPK .. |
28 | 1-4-3 ژن حساس به اکسین . |
33 | فصل دوم: مواد و روشها |
34 | 2-1 شرایط رشد . |
34 | 2-1-1 نحوه تیماردهی گیاهان |
35 | 2-1-2 برداشت نمونه |
35 | 2-1-2-1 برداشت نمونه جهت انجام بررسیهای مولکولی .. |
35 | 2-1-2-2 برداشت نمونه جهت انجام بررسیهای فیزیولوژیک |
36 | 2-2 روش های بکار گرفته شده در آزمایشات مولکولی .. |
36 | 2-2-1 پودر کردن و آماده سازی نمونه جهت استخراج RNA …………………………………………………………. |
36 | 2-2-2 استخراج RNA از بافت گیاهی…………………………………………………………………………………………………… |
36 | 2-2-3 اندازه گیری میزان غلظت RNA و رقیق سازی نمونهها………………………………………………………………….. |
37 | 2-2-4- روش تهیه cDNA……………………………………………………………………………………………… |
37 | 2-2-5- واکنش RT-PCR……………………………………………………………………………………………… |
38 | 2-2-6 تهیه ژل الکتروفورز…………………………………………………………………………………………………………………….. |
38 | 2-2-6-1 تهیه TBE 5X…………………………………………………………………………………………………
|
38 | 2-2-7 پرایمرهای استفاده شده در این پژوهش…………………………………………………………………………………………. |
38 | 2-3 روشهای بکار گرفته شده در آزمایشات فیزیولوژیکی…………………………………………………………………………… |
38 | 2-3-1 طرز تهیه عصاره گیاهی جهت تعیین میزان فعالیت آنزیم های آسکوربات و گایاکول پراکسیداز……………………. |
39 | 2-3-1-1 اندازه گیری فعالیت آنزیم آسكوربات پراكسیداز(APX)……………………………………………………… |
39 | 2-3-1-2 اندازه گیری فعالیت آنزیم گایاكول پراكسیداز(GPX)……………………………………………………….. |
39 | 2-3-2 سنجش فعالیت آنزیم کاتالاز……………………………………………………………………………………………………………….. |
40 | 2-3-3 اندازه گیری میزان پراکسیداسیون چربیها (MDA)………………………………………………………………………………. |
40 | 2-3-4 اندازه گیری پروتئین کل……………………………………………………………………………………………………………. |
41 | 2-3-5 اندازه گیری قندهای محلول…………………………………………………………………………………………………………………. |
41 | 2-4 آنالیزهای آماری………………………………………………………………………………………………………………………….. |
42 | فصل سوم: نتایج…………………………………………………………………………………………………………………………………. |
43 | 3-1 نتایج حاصل از بررسیهای انجام یافته در سطح مولکولی……………………………………………………………………………. |
43 | 3-1-1 بررسی بیان ژن Protein Kinase تحت اثر تنش خشکی در گیاه کلزا (B.napus)…………………………. |
45 | 3-1-2 بررسی بیان ژن MAPK4 تحت اثر تنش خشکی در گیاه کلزا (B.napus)……………………………………. |
46 | 3-1-3 بررسی بیان ژن MAPK3 تحت اثر تنش خشکی در گیاه کلزا (B.napus)……………………………………. |
48 | 3-1-4 بررسی بیان ژنAuxin responsive protein تحت اثر تنش خشکی در گیاه کلزا (B.napus)…………… |
49 | 3-2 بررسی نتایج حاصل از آزمایشات فیزیولوژیکی……………………………………………………………………………………………. |
49 | 3-2-1 بررسی اثر تنش خشکی بر میزان فعالیت آنزیم گایاکول پراکسیداز (GPX) درگیاه کلزا……………………………… |
50 | 3-2-2 بررسی اثر تنش خشکی بر میزان فعالیت آنزیم آسکوربات پراکسیداز (APX) درگیاه کلزا…………………………….. |
52 | 3-2-3 بررسی اثر تنش خشکی بر میزان فعالیت آنزیم کاتالاز (CAT) درگیاه کلزا…………………………………………….. |
53 | 3-2-4 بررسی اثر تنش خشکی بر میزان مالوندیآلدهید (MDA) درگیاه کلزا………………………………………………… |
55 | 3-2-5 بررسی اثر تنش خشکی بر میزان پروتئین کل درگیاه کلزا………………………………………………………………………….. |
55 | 3-2-6 بررسی اثر تنش خشکی بر میزان قندهای محلول درگیاه کلزا……………………………………………………………………… |
57 | فصل چهارم: بحث و بررسی……………………………………………………………………………………………………………………………. |
58 | 4-1- بررسیهای انجام شده در سطح مولکولی…………………………………………………………………………………………………… |
61 | 4-2 بررسیهای انجام شده در سطح فیزیولوژیکی………………………………………………………………………………………………. |
66 | 4-3 نتیجه گیری کلی……………………………………………………………………………………………………………………………………….. |
67 | 4-4 پیشنهادات……………………………………………………………………………………………………………………………………. |
68 | 5- ضمائم………………………………………………………………………………………………………………………………………….. |
71 | 6- منابع……………………………………………………………………………………………………………………………………………. |
چکیده
تغییرات مداوم آب وهوا، مسئول القای چندین عامل تنشزا در گیاهان میباشد. در بین این عوامل، خشکی بهعنوان مهمترین تنش غیرزیستی شناخته می شود. برای مقابله با این شرایط گیاه باید قادر به درک، پاسخدهی و سازگاری نسبت به این تغییرات محیطی بوده و فعالیتهای فیزیولوژیکی خود را تغییر دهد. صدها ژن در گیاهان در پاسخ به تنش رطوبتی القا میشوند. شناسایی و بررسی ویژگیهای ژنهای تنظیم کننده کلیدی دخیل در تحمل خشکی اهمیت فوقالعادهای در بهبود ژنتیکی گیاهان دارد. در این تحقیق از دو رقم حساس و مقاوم به خشکی گیاه کلزا (Brassica napus L.) بنامهای Okapi (حساس به خشکی) و Zarfam (مقاوم به خشکی) استفاده شد. هدف از این پژوهش مطالعه بیان 4 ژن درگیر در مسیر ترارسانی علامت (signal transduction) تحت تنش خشکی در دو رقم اکاپی و زرفام میباشد. بعد از استخراج RNA و ساخت cDNA، پروفایل بیان 4 ژن شامل Protein kinas (PK) ، Auxine– responsive protein، MAPK3 و MAPK4 در زمانهای 0، 3، 12و 24 ساعت خشکی تحت تیمار مانیتول mM 200 در گیاهچههای 8 روزه کلزا با تکنیک RT-PCR بررسی شد. آزمایش روی کل گیاهچه (Seedling) انجام گرفت. نتایج نشان داد که ژنهای، Protein kinas (PK) و MAPK4 در رقم حساس، به طور معنیداری افزایش و در رقم مقاوم، به طور معنیداری کاهش سطح بیان نشان داده است. همچنین میزان بیان ژن MAPK3 در هر دو رقم افزایش یافته، ولی میزان بیان ژن Auxine- responsive protein در رقم حساس افزایش و در رقم مقاوم کاهش پیدا کرده است. شناخت دقیق نقش این ژنها، اصول استراتژی های مهندسی ژنتیک موثری برای بهبود تحمل تنش کلزا به ما ارائه خواهد داد. علاوه بر تاثیر تنش مذکور در سطح مولکولی، پاسخ گیاهان در سطح فیزیولوژیکی نیز مورد بررسی قرار گرفت. تنش خشکی موجب احساس کمبود آب در گیاه و در نتیجه بسته شدن روزنهها و افزایش احتمال تولید گونه های اکسیژن فعال در گیاهان میگردد. افزایش فعالیت آنزیم های APX و GPX و CAT، بهعنوان آنتی اکسیدان آنزیمی، دلالت بر این فرایند درون سلولی دارد. با توجه به نتایج بدست آمده، افزایش ROS موجب افزایش پراکسیداسیون چربی و در نتیجه افزایش سطح MDA در گیاه گردید. تجمع محلولهای سازگار نیز از جمله مکانیسمهای دفاعی گیاه در برابر تنش کم آبی بوده که خود را در تجمع کربوهیدراتها در گیاه نشان داد. با بررسی مطالب فوق نتیجه گیری شد که تنش خشکی اثر زیانباری بر رشد گیاه کلزا داشته و رقم اکاپی دارای حساسیت بالا و رقم زرفام دارای حساسیت پائینی نسبت به تنش خشکی میباشد.
کلمات کلیدی: تنش خشکی، بیان ژن، کلزا، RT-PCR
فرم در حال بارگذاری ...
[دوشنبه 1399-10-01] [ 12:58:00 ق.ظ ]
|