پایان نامه بررسی پلی مورفیسمT) 509C-)، ژن TGF-β1 در بیماران مبتلا به ریفلاکس وزیکویورترال(VUR) به روش PCR-RFLP در استان کرمان |
عنوان فهرست مطالب شماره صفحه
چکیده فارسی…………1
فصل اول: کلیات تحقیق
1-1 ریفلاکس وزیکویورترال(VUR) 3
1-2 شیوع VUR. 4
1-3 سبب شناسی VUR. 5
1-4 VUR از منظر کلینیکی. 6
1-5 نشانه شناسی VUR. 10
1-6 پروگنوزیس VUR. 10
1-7 روش های تشخیصیVUR. 10
1-7-1 سونوگرافی. 11
1-7-2 سیستوگرام در حال ادرار(MCUG or VCUG) 11
1-7-3سیستوگرافی تخلیه ای رزونانس مغناطیسیMRVCUG 12
1-7-4 سیستوگرافی رادیو نوکلئویدRNC 12
1-7-5 سیستوگرافی رادیونوکلئوید مستقیم DRC. 13
1-7-6 سیستوگرافی رادیونوکلئوید غیر مستقیمIRC. 14
1-8بهبود خود به خود VUR. 15
1-9 درمان ریفلاکس وزیکویورترال. 16
1-9-1 پیشگیری آنتی بیوتیکی. 16
1-9-2 جراحی باز 17
1-9-3 تزریق آندوسکوپی. 17
1-10 VURفامیلی. 18
1-11 شناسایی یک ژن یا لوکوس ویژه مرتبط با VUR. 19
1-11-1 uroplakin. 20
1-11-2 SLIT2/ROBO2. 20
1-11-3 Transforming growth factor-β1. 20
1-12 اصول کلی واکنش زنجیره ای پلیمراز 25
1-12-1 مواد مورد نیاز برای واکنش PCR. 26
1-13 آنالیز PCR-RFLP. 27
1-14روش های آنالیز برای مطالعات وابستگی SNP. 28
1-15 اهمیت موضوع. 29
1-16 فرضیه های مطالعه 31
1-17 هدف از مطالعه 31
فصل دوم: مروری بر متون گذشته
2-1 بررسی ارتباط پلی مورفیسم ژن TGF-β1 با VUR فامیلی. 34
فصل سوم: مواد و روش ها
3-1 نوع مطالعه 37
3-2 جامعه مورد مطالعه 38
3-2-1 گروه بیمار 38
3-2-2 گروه سالم 38
3-3 نمونهگیری. 38
3-4 متغیرهای تحقیق. 38
3-5 استخراج DNA. 39
3-6 اندازه گیری کیفیت و غلظت DNA. 40
3-7 دستورالعمل PCR برای نشانگر PCR-RFLP. 41
3-7-1 طراحی پرایمرها اختصاصی برای تعیین SNP. 41
3-7-2 dNTPs 41
) 42
3-7-4 بافر واکنش PCR. 42
3-7-5 آنزیم Taq Polymerase. 42
3-7-6 آب دوبار تقطیر شده استریل. 42
3-8 راه اندازی واکنش PCR. 42
3-9 برنامه دمایی PCR. 43
3-10 الکتروفورز ژل آگارز 43
3-10-1مواد لازم الکتروفورز ژل آگاروز2%.. 43
3-10-2 طرز تهیه ژل آگارز 2%.. 43
3-10-3طرز تهیه بافر TBE 1X. 44
3-10-4طرز تهیه اتیدیومبرماید 44
3-11 هضم آنزیمی. 44
3-12 روش تجزیه و تحلیل داده ها : 45
3-13بررسی تعادل هاردی-واینبرگ. 46
3-14 آزمون كای دو )رابطه بین دو متغیر كیفی) 47
3-15 روش آماری. 47
3-16 آزمون استقلال کای اسکوئر 47
3-17آزمون نیکویی برازش کای اسکوئر 47
3- 18 انحراف معیار از میانگین (SE, SEM) 48
فصل چهارم: نتایج
4-1 نتایج هضم آنزیمی. 50
4-2مقایسه ی توزیع فراوانی پلی مورفیسم ژن TGFB1 در كودكان مبتلا به ریفلاكس وزیكویورترال با كودكان سالم 51
4-3نحوه آنالیز ژنوتیپ های CC،TC و TT. 52
4-3-1 آنالیز ژنوتیپ های CC،TC وTT در دو گروه بیماران مبتلا به ریفلاكس وزیكویورترال و گروه كنترل زمانیكه ژنوتایپ CCبه عنوان مرجع (رفرنت ) باشد. 52
4-3-2 آنالیز ژنوتیپ های CC،TC و TT در دو گروه بیماران مبتلا به ریفلاكس وزیكویورترال و گروه كنترل زمانیكه ژنوتایپ TT به عنوان مرجع (رفرنت ) باشد. 54
4-4 آنالیز آلل های T و C در دو گروه كودكان مبتلا به ریفلاكس وزیكویورترال و كودكان سالم (گروه كنترل) 55
4-5 بررسی تعادل هاردی واینبرگ در گروه كودكان مبتلا به ریفلاكس وزیكویورترال. 57
4-6 بررسی تعادل هاردی واینبرگ در گروه كودكان سالم (كنترل) 58
4-7 انحراف معیار از میانگین. 59
فصل پنجم: بحث و نتیجه گیری
5-1 پیشنهادات: 65
66
عنوان فهرست اشکال شماره صفح
شکل1-1 سیستم درجه بندی مطالعه جهانی ریفلاکس……………………………………………………………………………………………..3
شکل2-1 اتصال یوترووزیکال………………………………………………………………………………………………………………………………………..4
شکل3-1 نمایی از کانال حالب درون دیواره مثانه……………………………………………………………………………………………………….7
شکل4-1 مثال های کلینیکی از مطالعه ریفلاکس………………………………………………………………………………………………………9
شکل5-1 VCUG در کودک 4 ساله نشان دهده برگشت دو طرفه ادرار ……………………………………………………………….12
شکل6-1 نقشه ژن TGF-beta1 انسانی……………………………………………………………………………………………………………………23
شکل7-1 تصویر شماتیک نحوه انجام PCR ……………………………………………………………………………………………………………26
شکل8-1 روش های آنالیز برای مطالعات وابستگی SNP ……………………………………………………………………………………….29
شکل1-3 تصویر مربوط به بررسی نتیجه استخراج DNA روی ژل آگارز………………………………………………………………..40
شکل1-4 قطعه حاصل از تکثیر پی سی آر (808 جفت باز)…………………………………………………………………………………..50
شکل2-4 سه ژنوتیپ حاصل از هضم آنزیم……………………………………………………………………………………………………………….50
عنوان فهرست جداول شماره صفحه
جدول1-1 ژنها و مکان های ژنی بالقوه دخیل در تکامل کلیه و یا مثانه …………………………………………………………………..24
جدول 1-3 مربوط به متغیرهای تحقیق…………………………………………………………………………………………………………………….39
جدول 2-3 پرایمرها اختصاصی…………………………………………………………………………………………………………………………………..41
جدول 3-3 مواد و مقادیر لازم برای واکنش هضم آنزیمی یک نمونه………………………………………………………………………..45
جدول 4-3 محاسبه مرحله به مرحله ژنوتیپ های مورد انتظار………………………………………………………………………………..46
جدول 1-4 فراوانی ژنوتیپ های CC،TC و TT…………………………………………………………………………………………………….51
جدول 2-4 فراوانی ژنوتایپ های CC،TC و TT…………………………………………………………………………………………………53
جدول 3-4 آزمون کای اسکوئر در دو گروه كودكان مبتلا به ریفلاكس و كودكان سالم………………………………………….53
جدول 4-4 تخمین ریسک برای هنگامی که cc رفرنت فرض شده………………………………………………………………………….53
جدول5-4 فراوانی ژنوتایپ های CC،TC و TT …………………………………………………………………………………………………..54
جدول6-4 آزمون کای اسکوئر ژنوتیپ TT رفرنت در نظر گرفته می شود………………………………………………………………54
جدول 7-4 تخمین ریسک برای هنگامی که TT رفرنت فرض شده………………………………………………………………………..55
جدول8-4 فراوانی آلل های T و C…………………………………………………………………………………………………………………………….55
جدول9-4آزمون کای اسکوئر برای بررسی آلل های Tو C……………………………………………………………………………………….56
جدول10-4 تخمین ریسک برای آلل ها TوC………………………………………………………………………………………………………….56
جدول11-4 فراوانی ژنوتیپ های مشاهده شده و مورد انتظار در گروه كودكان مبتلا به ریفلاكس وزیكویورترال…………………………………57
جدول12-4 آزمون کای اسکوئر نیکویی برازش برای بررسی HWE در كودكان مبتلا …………………………………………58
جدول13-4فراوانی ژنوتیپ ها ی مشاهده شده و مورد انتظار در گروه كودكان سالم………………………………………………58
جدول14-4 آزمون کای اسکوئر نیکویی برازش برای بررسی HWE در گروه كودكان سالم………………………………….59
جدول15-4 محاسبه sem داده ها در spss……………………………………………………………………………………………………………..59
جدول 1-5 مقایسه کلی نتایج ژنوتیپ ها و آلل های مورد مطالعه…………………………………………………………………………..63
چکیده فارسی
مقدمه و هدف: دسته بندی فامیلی ریفلاکس وزیکویورترال پیشنهاد می دهد که فاکتورهای ژنتیکی نقش مهمی در پاتوژنز ریفلاکس وزیکویورترال دارند. TGF-β1 یک پپتید چند عملکردی است که کنترل رشد و تمایز را در بسیاری از انواع سلول ها بر عهده دارد. پلی مورفیسم های TGF-β1 با احتمال ابتلا به VUR و UTI مرتبط می باشند. با توجه به اهمیت پلی مورفیسم T509C- ژن TGF-β1 و ارتباط آن با ریفلاکس وزیکویورترال اولیه، در این مطالعه تلاش کردیم ارتباط این پلی مورفیسم با بیماری ریفلاکس وزیکویورترال را پیدا کنیم.
روش کار: این مطالعه شامل 160 نمونه و کنترل بود، ژنوتایپینگ با روش PCR-RFLP انجام گرفت و محصولات PCR توسط آنزیم BSU36I مورد هضم آنزیمی قرار گرفتند و سپس بر روی ژل آگارز 3 درصد بررسی شدند و در نهایت داده ها با بهره گرفتن از نرم افزار SPSSv.19 مورد تجزیه تحلیل آماری قرار گرفتند.
نتایج: فراوانی ژنوتیپ TT در گروه بیماران افزایش قابل توجهی نسبت به گروه کنترل داشت( 30 درصد بیمار در مقابل 5/7 درصد شاهد 0/0 PV≤) ،اگر چه فراوانی ژنوتیپ CC کاهش قابل توجهی نسبت به گروه کنترل داشت (5/32 درصد بیمار در مقابل 75/58درصد شاهد 001/0 PV≤). همچنین، فراوانی آلل Tدر گروه بیماران افزایش قابل توجهی نسبت به گروه کنترل داشت( 75/48 درصد بیمار در مقابل37/24 درصد شاهد 00/0 PV≤ ) و فراوانی آللC نیز در گروه بیماران کاهش قابل توجهی را نسبت به گروه کنترل نشان داد ( 25/51درصد بیمار در مقابل 62/75 درصد شاهد 00/0 PV≤ ) .
فرم در حال بارگذاری ...
[دوشنبه 1399-10-01] [ 12:50:00 ق.ظ ]
|